Новомученик Николай Варжанский родился в 1881 году в местечке Искорость Волынской губернии в семье волостного писаря Георгия Варжанского. В 1897 году он окончил Житомирское духовное училище, в 1903 году — Волынскую духовную семинарию, в 1907-м — Московскую духовную академию со степенью кандидата богословия.
В 1907 году Николай женился на девице Зинаиде, дочери протоиерея Неофита Любимова, настоятеля Воскресенской церкви на Ваганьковском кладбище в Москве, известного миссионера и проповедника, имевшего свое издательство, выпускавшее миссионерскую и апологетическую литературу.
В 1908 году Николай Варжанский был назначен сначала на должность помощника противосектантского миссионера Московской епархии, а затем — московского епархиального миссионера. С 1911 года, не оставляя миссионерской деятельности, он служил в канцелярии Святейшего Синода и преподавал в Московской духовной семинарии.
За десять лет им было написано и издано около сорока книг и брошюр на миссионерские темы, касающиеся борьбы с сектами. Одним из выдающихся явлений миссионерской просветительской деятельности того времени было издание написанной им книги «Доброе исповедание. Православный противосектантский катехизис», вышедшей в 1910 году. Книга быстро разошлась, и в 1912 году вышло второе издание.
Николай Георгиевич получил множество положительных отзывов на свою книгу. Выдающийся миссионер, впоследствии мученически скончавшийся, епископ Прилукский Сильвестр (Ольшевский) писал ему: «Сердечно благодарю Вас за присланные мне Вами Ваши прекрасные миссионерские книжки. Вашими трудами мы понемногу пользуемся, так как они очень по сердцу пришлись моим сотрудникам по миссионерскому делу. Укрепи Вас Господь продолжать свое святое дело!».
31 мая 1918 года Николай Георгиевич зашел на квартиру протоиерея Иоанна Восторгова, где в это время шел обыск, и был арестован и заключен в Бутырскую тюрьму. Ордер на его арест был выписан лишь на следующий день.
7 июня следователь ЧК допросил Николая Георгиевича. Отвечая на его вопросы, исповедник сказал: «Выступая с проповедью, я никогда не касался политических вопросов, за исключением тех пунктов, которые соприкасаются с церковной жизнью. С Восторговым я познакомился еще будучи студентом, когда он был московским епархиальным миссионером, интересуясь религиозными вопросами. В каких политических партиях в это время состоял Восторгов, меня мало интересовало. Листовку "Сказание о чудотворном образе святого Угодника Божия святителя Николая Чудотворца" редактировал я.Издавая листовку, я преследовал цели осведомительного характера и поддержания религиозных чувств в народе».
Сразу же после ареста Николая Георгиевича в ЧК стало обращаться множество людей и организаций с просьбой о его освобождении. К этим многочисленным просьбам об освобождении исповедника присоединился и Патриарх Тихон. Но всем просителям ЧК давала только один ответ — отклонить. 20 июня следователь, ведший дело, предложил всех обвиняемых по делу, связанных с протоиереем Иоанном Восторговым, включая Николая Варжанского, расстрелять. 14 августа в Верховный революционный трибунал обратилась супруга арестованного, Зинаида, с просьбой предоставить ей личное свидание с мужем, но ей в этом было отказано.
19 сентября 1918 года Николай Варжанский был расстрелян, а затем погребен на пустыре за оградой Калитниковского кладбища в Москве. На могиле родственниками был установлен металлический крест с надписью, но впоследствии крест был сломан, место захоронения утрачено.